2012年，我院大力实施 “两大提升工程”，结合创三甲工作，完善了医院学科架构，加强了专科建设，带动了医院整体医疗水平的提升。目前，我院已建立了包括内、外、儿童重症医学、口腔、眼科、耳鼻喉、口腔正畸、康复、中医、皮肤、儿童保健等19个临床一级科室，涵盖了儿童综合医院的所有专业。
 
    今年我院学科建设主要完成了如下工作：
 
    一是进一步完善了二、三级学科建设，理顺了门诊条块管理关系，成立了预防保健科、消化科、感染科、营养科、遗传代谢专业组、内分泌专业组、肿瘤协作组、外科手术治疗癫痫协作组等，遴选了专业负责人，负责制定专业发展规划和人才培养计划，并给专业负责人一定的时间从事科研工作,使各专科工作得以开展。按照创建三甲医院要求，增设了青春期妇科、疼痛科、营养科等诊疗科目，使医院专科设置更加科学合理，进一步满足了社会的就医需求。
  
    二是加强专科建设，悉心培育重点医学专科。我院继小儿内科群（小儿血液、小儿免疫、小儿呼吸、小儿神经病学专业、新生儿专业、）、小儿外科、儿童重症医学科通过了市级重点专科认定后，小儿呼吸专业今年被确定为广东省首批“十二五”医学重点学科，实现了我院省重点医学学科零的突破。我院“深圳儿童重症疾病分子诊断重点实验室”在全市各行业共200多家参评实验室中，以第一名的成绩，高分通过了深圳科技创新委的评审，获得了500万元的资助。
 
    三是小儿外科进一步完善二、三级学科建设，提高了医疗技术水平。今年我院小儿肝胆、肿瘤外科及肛肠外科、脑外科、新生儿外科、泌尿外科、骨外科、心胸外科等专科均得到长足发展，手术例数尤其是高难度手术例数增加，吸引了市外、省外患者求医。我院癫痫治疗团队已为6名灾难性癫痫综合征患儿提供外科手术治疗，取得了良好疗效。海南一名4个月大的癫痫患儿慕名来我院求医，完成了手术后痊愈，该例患儿手术年龄在全国也是最小的。小儿胆道腹腔镜手术是小儿微创外科难度最大的手术，是代表医院微创外科技术的旗帜。我院肝胆外科率先在广东省开展了腹腔镜胆总管囊肿和胆道闭锁手术，目前已完成胆总管囊肿70例，病例数在国内名列前茅。完成胆道腹腔镜探查近100例，完成腹腔镜下葛西手术25例。目前我院肝胆微创专科患者除来自市内、省内的以外，还有来自广西、江西、四川、湖南等外省的患者，甚至有患者专门从北非到该科就诊，接受腹腔镜胆道闭锁手术，取得了满意的效果。
 
    四是小儿内科各专业优势继续巩固，部分专科如小儿风湿免疫、小儿呼吸 、小儿癫痫 、新生儿科等优势明显，特色突出，处于市内、省内、甚至国内先进水平。血液肿瘤科今年成功开展了四例亲缘性脐带血造血干细胞移植治疗重型地中海贫血，患儿获得了临床治愈，摆脱了依靠输血存活的困境。目前正在进行第五例移植手术，进展顺利。
 
    专科建设提升了医院品牌内涵，医院整体医疗技术水平不断提高，获得了较好的社会效益及经济效益，今年1-11月我院专科就诊人次达377039人次，占门诊人次的32.27%（2011年同期217674人次，占门诊总人次的19.3％），同比增长了73.2%。